A ver si es lo que quieres.
Básicamente es lo que ya tienes. Duplicas la capa. A la de debajo le quitas todos los efectos de capa (el bisel, el brillo, etc, etc) excepto la superposición de motivo si has hecho de esta forma el que salga la molécula. Si no; dime como lo has hecho y ya te explico los cambios. La intención es que la capa que esté por debajo sólo salgan las letras y las moléculas dentro.
En la capa de arriba; al revés. Todos los efectos activados menos la superposición si la tienes. En esta el relleno a cero. La intención es que sólo se vean los efectos en esta capa.
De esta forma tiene el mismo resultado pero en dos capas distintas. ¡Qué tontada! -dirá mas de uno- Esperate que no hemos acabado.
Ahora seleccionas la capa de debajo, la del texto con el motivo de las moléculas. Te vas al menú capas y seleccionas Máscara de capas-Descubrir todas y te sale un nuevo cuadradito en la capa. Tal que así.
Este cuadrito es la máscara de la capa. La cosa funciona que lo que en este cuadrado esté pintado en blanco puro se ve igual. Lo que está pintado en negro no se ve y lo que esté pintado en gris se verán con mas o menos transparecnia según lo cercano al blanco o al negro que esté.
Picando en el cuadrito te deja pintar normalmente en la capa. Para volver a pintar en el dibujo de la capa pica sobre el otro cuadro de la misma capa. Notarás que el reborde va cambiando de un cuadrito a otro segun picas indicando así dónde estás pintando. Si en dibujo o en la máscara.
Bien. Seleccionas la máscara y pintas una degradación vertical de blanco (arriba) a negro (abajo) y notarás que el relleno de las letras se va fundiendo con el dibujo. Pero al respetarte los biseles, brillos y demás por que están en la otra capa la forma de las letras no se pierde.
Creo que es el efecto que buscas.
Te cuelgo el PDS por si lo ves mas claro metiendo las narices en el archivo. Le pueds cambiar el tipo de letra y hacer los ajustes que veas conveniente.
http://www.megaupload.com/?d=ME5D9O49
Por si te gusta el dibujillo de la molécula que va en el archivo. Mejor no lo uses por que es el del tetrahidrocannabinol. Que no lo busqué queriendo. Busqué moléculas y salió esa. No se si son mensajes ocultos que me manda google o que me conoce demasiado bien.